Az igazgatóság szakembereinek irányításával civil természetvédő szervezetek tagjai, általános iskolások és egyetemisták működnek közre a békamentésben. A mentés során a kiépített, karbantartott békaterelő kerítés mellől, vagy a kerítésen már átjutott varangyokat összeszedik, és átviszik az Ipoly árterületére.

Ez a munka, a fagyos napok miatti kisebb megszakításokkal két hétig is eltarthat. Az igazgatóság tájékoztatása szerint az elmúlt években az önkéntes békamentők tizenegy-tizenkétezer példányt segítettek át a veszélyes útszakaszon. A hazánkban élő mind a tizenkét békafaj védett.